Zendesk でもGoogle Toolは使えます。
集客という観点で使うのはおかしい。という見方もありますが、カスタマーケアとしてだけではなく、ビジネスに寄与するSEO対策はできそうです。
metaタグの追加もカスタマイズで対応できますので、教科書的なSEO対策から始めていけば、それなりな成果がでる見込みが出せます。
Search Consoleの設定は弊社の場合、カスタムドメインにしているので、DNS設定で対応しました。また、GA4はGoogle Tag Managerを入れたのち、設定して運用しています。
まだまだ、構築したばかりでデータに信頼性がないので、数ヶ月先からの検証にはなりますが、CMSとしてのZendeskには期待しています。